A Unidade de Programação Orçamentária e Financeira - UPOF, subordinada ao Setor de Orçamento e Finanças , tem entre suas competências:

I. Solicitar à sede da EBSERH a descentralização dos créditos orçamentários, observando a programação aprovada e os limites orçamentários previamente estabelecidos;
II. Elaborar os demonstrativos necessários a subsidiar a declaração de disponibilidade orçamentária, pelo Ordenador de Despesas, para fins de contratação de bens ou serviços;
III. Emitir pré-empenhos para licitação de obras e serviços, para aquisição de material permanente e de consumo; (não se aplica)
IV. Emitir empenhos para as aquisições de materiais, contratação de serviços e outras operações realizadas;
V. Acompanhar a execução orçamentária, verificando a liquidação de empenhos e promovendo a recomposição dos saldos, cancelamentos ou reforço, quando devidamente autorizado e de acordo com as necessidades e justificativas apresentadas; e
VI. Apresentar relatórios periódicos contendo análise da gestão orçamentária do hospital.