A Gerência de Ensino e Pesquisa (GEP) é responsável por analisar e viabilizar as propostas de ensino e pesquisa nos níveis técnico, de graduação e pós-graduação do HU-UFS. Um dos seus principais objetivos é proporcionar cenários adequados para estas atividades, visando à integração entre a assistência, o ensino e a pesquisa e a geração de conhecimentos para melhoria ao atendimento dos pacientes do SUS.